آخرین سامورایی - در دهه 1870، کاپیتان ناتان آلگرن (تام کروز)، کهنه سرباز بدبین از جنگ داخلی آمریکا، که برای هر کسی کار خواهد کرد، توسط آمریکایی هایی که خواهان قراردادهای پرسود با امپراتور ژاپن هستند استخدام می شود تا سربازان وظیفه دهقان را برای اولین ارتش امپراتوری ایستاده در جنگ های مدرن با استفاده از سلاح گرم آموزش دهند. اولین اولویت کابینه امپراتوری اومورا (ماساتو هارادا) سرکوب شورش سامورایی‌های سنت‌گرا، جنگجویان موروثی است که به سلسله مقدس پایبند هستند، اما سیاست غرب‌گرایی را رد می‌کنند و حتی از سلاح گرم خودداری می‌کنند. با این حال، هنگامی که نیروی برتر او که به خوبی آماده نشده بود، خیلی زود به راه می‌افتد، وحشت آنها به سامورایی‌های شمشیردار اجازه می‌دهد تا آنها را درهم بشکنند. ایستادگی شجاع آلگرن که به شدت زخمی شده است باعث می شود رهبر سامورایی ها کاتسوموتو (کن واتانابه) جان خود را از دست بدهد. هنگامی که از سلامتی مراقبت می کند، یاد می گیرد که روش قدیمی ژاپنی را بشناسد و به آن احترام بگذارد، و به عنوان مشاور در تلاش شکست خورده کاتسوموتو برای نجات سنت بوشیدو شرکت می کند، اما اومورا قوانین سرکوبگرانه وضع می کند. او اکنون باید انتخاب کند که وفاداری خود را به یکی از طرف های تلخ در زمانی که درگیری به میدان نبرد باز می گردد، ارج بگذارد.