ابری با احتمال بارش کوفته‌قلقلی ۲ - پس از طوفان غذایی فاجعه‌آمیز در فیلم اول، فلیت و دوستانش مجبور می‌شوند که شهر را ترک کنند. فلیت دعوت از الگوی خود، چستر وی، را می‌پذیرد تا به شرکت لایو کورپ بپیوندد، شرکتی که مسئول پاکسازی جزیره است و در آن بهترین مخترعان جهان فناوری‌هایی برای بهبود بشر ایجاد می‌کنند. زمانی که فلیت متوجه می‌شود که دستگاه او هنوز کار می‌کند و حالا غذاهای جهش‌یافته‌ای مانند ترشی‌های زنده، تاکودایلات گرسنه، میگوپانزی‌ها و پای‌سیب‌تورها را می‌سازد، او و دوستانش باید به جزیره بازگردند تا جهان را نجات دهند.