ایندیانا جونز و پادشاهی جمجمه کریستالی - در طول جنگ سرد، مأموران شوروی، پروفسور هنری "ایندیانا" جونز جونیور (هارسون فورد) را زیر نظر می‌گیرند، زمانی که یک مرد جوان پیامی رمزگذاری شده از همکار سالخورده و دچار زوال عقل او، پروفسور هارولد اکسلی (سر جان هارت)، برایش می‌آورد. به رهبری ایرینا اسپالکو (کیت بلانشت) که فردی باهوش است، شوروی‌ها جونز و مرد جوان، مات ویلیامز (شایا لابوف)، را تا پرو تعقیب می‌کنند. با استفاده از رمز اکسلی، آنها جمجمه‌ای افسانه‌ای را پیدا می‌کنند که از یک قطعه کوارتز ساخته شده است. اگر جونز بتواند جمجمه را به جایگاه rightful خود بازگرداند، ممکن است همه چیز به خوبی پیش برود. اما اگر ایرینا آن را به مبدأ خود ببرد، قدرتی به دست خواهد آورد که می‌تواند غرب را به خطر بیندازد. پروفسور سالخورده و جوان تازه‌کار با زنی از گذشته جونز، ماریون ریونوود (کارن آلن)، متحد می‌شوند تا با خطرات جنگل، روسیه و نیروهای ماوراءطبیعی روبرو شوند.