در دوران خشونت‌آمیزی که با عنوان باکوماتسو شناخته می‌شد، یک قاتل ایشین که فقط با نام هیتوکیری باتوسای[۱] شناخته می‌شد، مهارت و خشونتش به مانند افسانه‌ای در عصر بازگرداندی شده بود که او نیز نقش بسزایی در پیروزی انقلابیون داشت. با نزدیک شدن به اتمام زمان جنگ، بدون اینکه هیچ رد پایی از خود به جای بگذارد ناپدید شد، و یازده سال بعد فقط به عنوان یک شمشیرزن سرگردان با نام «هیمورا کنشین» به پا خاست. او به مکان‌های مختلفی مهاجرت می‌کند تا به منظور جبران و کفاره‌ای برای کشتار و گناهانی که در گذشته مرتکب شده باشد و بتواند از مردم عادی محافظت کند...