یک گروه مرموز از نینجاها به نام Sora-nin از کشور آسمان یک حمله غافلگیرانه به کونوها انجام می دهند. این به این دلیل است که کونوها در طول آخرین جنگ جهانی شینوبی تقریباً سرزمین آسمان را نابود کرده بود، با این حال آنها جان سالم به در بردند و اکنون آنها یک ...