پرونده‌های مجهول: می‌خواهم باور کنم - فاکس مولدر (دیوید دوکاونی) و دانا اسکالی (گیلین اندرسن) به‌عنوان شریک در اف‌بی‌آی کار می‌کردند، پیوندی بین آن‌ها که منجر به تبدیل شدنشان به عاشق یکدیگر شد. اما اکنون آن‌ها از اف‌بی‌آی خارج شده‌اند و شروع به حرفه‌های جدیدی کرده‌اند. اسکالی به‌عنوان پزشک مسئول در یک بیمارستان کاتولیک کار می‌کند. تمرکز او این روزها روی یک پسر جوان با بیماری مغزی غیرقابل درمان است. اداره بیمارستان می‌خواهد از او دست بکشد، اما اسکالی که ارتباط خاصی با پسر احساس می‌کند، نمی‌خواهد این کار را بکند. در همین حال، تمرکز مولدر روی برش مقالات روزنامه، پرتاب مداد به سقف و نوشتن درباره پدیده‌های ماوراءالطبیعه است. اسکالی و مولدر دوباره به‌عنوان شریک به هم ملحق می‌شوند زمانی که یک پرونده خاص نیاز به تخصص مولدر دارد و از اسکالی خواسته می‌شود تا او را متقاعد کند که کمک کند. این پرونده مربوط به یک کشیش پدوفیل است که ادعا می‌کند دارای بینش‌های روانی است که در مورد مکان یک مامور مفقود شده اف‌بی‌آی اطلاعاتی دارد.