بتمن به همراه گروه اسکوبی دو در زمانی که شرورانی از هر دو دنیای آن‌ها برای ایجاد آشوب و هرج و مرج در شهر متحد می‌شوند، به هم می‌پیوندند. این دو تیم که از دنیای متفاوتی می‌آیند، برای مقابله با تهدیدات مشترک باید همکاری کنند. اسکوبی دو، شگی، دافنه، فرد و ولما همراه با بتمن و رابین برای حل معماهای پیچیده و مبارزه با شرورانی چون جوکر، دوفوس و دیگر دشمنان خطرناک، وارد عمل می‌شوند. در این مسیر، لحظات طنزآمیز و غیرمنتظره‌ای از ترکیب شخصیت‌های متفاوت به وجود می‌آید و این همکاری غیرمعمول نشان می‌دهد که حتی در دنیای پر از تهدید، دو گروه مختلف می‌توانند با هم متحد شوند تا عدالت را برقرار کنند.