موجود بیگانه میکروسکوپی هیدورا از طریق یک شهاب‌سنگ سقوط کرده به زمین می‌آید و از آلودگی‌های زمین تغذیه می‌کند و به یک هیولای عظیم، در حال تکامل، سمی که گاز و اسید ترشح می‌کند، تبدیل می‌شود. خدازیلا، مدافع زمین، تهدید را احساس می‌کند و با “هیولای دود” در نبردی واقعی برای بقای زمین روبه‌رو می‌شود. این داستان از نبردهای عظیم، تخریب‌های محیطی و تلاش برای حفظ زمین در برابر تهدیدی که خود انسان‌ها ایجاد کرده‌اند، پرده برمی‌دارد. در این ماجرا، خدازیلا نه تنها به‌عنوان یک قهرمان، بلکه به‌عنوان نمادی از تلاش برای مقابله با مشکلات محیطی به‌ویژه آلودگی‌های صنعتی و تهدیدات ناشی از آن شناخته می‌شود.